Stosując dietę białkową możemy (lecz nie musimy) zaobserwować niekorzystnych efektów. Wśród nich dominuje przede wszystkim wykształcenie złych nawyków żywieniowych oraz wprowadzenie modelu żywienia niezgodnego z prawidłowym, czyli takim który zaspokaja zapotrzebowanie organizmu na energię i składniki mineralne. Ponadto obciążenie organizmu nadmiarem białka może wpłynąć na zaburzenia równowagi kwasowo-zasadowej i obciążenie nerek, co może prowadzić do ich uszkodzenia o charakterze nieodwracalnym.

Produkty białkowe nie są źródłem wszystkich witamin i składników mineralnych, dlatego też dieta jest niedoborowa w witaminy A,C,E,K i kwas foliowy oraz w Mg, P, Fe, czy Cu. Jest ona również bardzo uboga w błonnik co może prowadzić do zaparć i dyskomfortu odczuwanego z przewodu pokarmowego.